ترکیب نئودیمیوم بور آهن بسیار سخت و شکننده است، بنابراین ماشین کاری در بهترین حالت هم دشوار است. سختی آهنربای نئودیمیوم RC46 در مقیاس راک وِل (Rockwell) در رتبه "C" است که سخت تر از دریل ها و ابزارآلات موجود در بازار است، بنابراین این ابزارها در صورت استفاده روی مواد نئودیمیوم بور آهن (NdFeB) گرم می شوند و آسیب می بینند.
ابزارآلات از جنس الماس، ماشین های تخلیه الکترواستاتیک (EDM) و ساینده ها روش های ارجح برای شکل دادن به مواد آهنربایی نئودیمیوم هستند. ماشین کاری آهنرباهای نئودیمیوم فقط باید توسط متخصصین باتجربه ای انجام شود که با ریسک و ایمنیِ این کار آشنا هستند. گرمای حاصل از ماشین کاری می تواند خاصیت آهنربایی را از بین ببرد و یا باعث آتش سوزی شود و ایمنی را به خطر بیندازد. پودر خشک تولید شده در هنگام ماشین کاری نیز بسیار اشتعال پذیر است و برای جلوگیری از احتراق این ماده باید بسیار مراقب بود.